Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC169A6NNP5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms