Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC69A6NI79 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms