Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF316A6NFI3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF316A6NFI3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.7 ms