Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRT87PA6NCN2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT87PA6NCN2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms