Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA8A3KMH1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA8A3KMH1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms