Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1W2PQD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms