Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PPC1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PPC1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms