Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms