Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0U1RQF3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms