Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00312Q9Y6C7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms