Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC1Q9Y5R8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms