Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARP1Q9Y4F1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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