Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG6Q9Y2V7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG6Q9Y2V7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG6Q9Y2V7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG6Q9Y2V7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG6Q9Y2V7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COG6Q9Y2V7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COG6Q9Y2V7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms