Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LEMD3Q9Y2U8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LEMD3Q9Y2U8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms