Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM2AQ9Y2K7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM2AQ9Y2K7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms