Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC8A2Q9UPR5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC8A2Q9UPR5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms