Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCAF8Q9UPN6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAF8Q9UPN6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms