Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMFRQ9UKV5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMFRQ9UKV5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms