Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SALL4Q9UJQ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SALL4Q9UJQ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms