Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUSP13Q9UII6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP13Q9UII6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms