Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAI1Q9UI46 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAI1Q9UI46 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAI1Q9UI46 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms