Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO40Q9UH90 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO40Q9UH90 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms