Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms