Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTNNAL1Q9UBT7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTNNAL1Q9UBT7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms