Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGNQ9P2M7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNQ9P2M7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms