Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP35Q9P2H5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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