Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC88CQ9P219 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC88CQ9P219 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms