Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SH3BP4Q9P0V3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4Q9P0V3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SH3BP4Q9P0V3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SH3BP4Q9P0V3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4Q9P0V3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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