Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HACD3Q9P035 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HACD3Q9P035 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms