Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC10Q9NYD6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXC10Q9NYD6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms