Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MTMR4Q9NYA4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR4Q9NYA4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms