Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB4Q9NTQ9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms