Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FARSBQ9NSD9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FARSBQ9NSD9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms