Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOMER3Q9NSC5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms