Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB6BQ9NRW1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB6BQ9NRW1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms