Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMPRSS4Q9NRS4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMPRSS4Q9NRS4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms