Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH2B1Q9NRF2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2B1Q9NRF2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms