Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC17Q9NP64 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC17Q9NP64 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms