Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMX1Q9NP08 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMX1Q9NP08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms