Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDM12Q9H4Q4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDM12Q9H4Q4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms