Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSTN2Q9H4D0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLSTN2Q9H4D0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms