Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms