Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHARPINQ9H0F6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms