Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIF3L1Q9GZT8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms