Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZYG11BQ9C0D3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZYG11BQ9C0D3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZYG11BQ9C0D3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZYG11BQ9C0D3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZYG11BQ9C0D3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZYG11BQ9C0D3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZYG11BQ9C0D3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZYG11BQ9C0D3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms