Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CIPCQ9C0C6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CIPCQ9C0C6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms