Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT23Q9C075 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT23Q9C075 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms