Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CELF4Q9BZC1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms