Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC2Q9BYS8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC2Q9BYS8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms