Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIFKQ9BYG3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIFKQ9BYG3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms